Innovation en microbiologie : diagnostic par biologie moléculaire des diarrhées infectieuses

Le plateau de microbiologie des laboratoires CBM25 propose depuis août 2017 un diagnostic syndromique des gastro entérites par des techniques d’amplification génique directement à partir des échantillons de selles (PCR multiplex).

Cette technique permet un diagnostic rapide (dès le jour du prélèvement) et performant des principaux agents infectieux ou des principales toxines responsables de diarrhées afin de lutter contre leur transmission et d’assurer une meilleure prise en charge des patients.

Les agents infectieux recherchés par PCR sont :
- Campylobacter sp. (C. jejuni et C. coli)
- Salmonella sp.
- Shigella sp.
- Escherichia producteur de shigatoxine
- Escherichia coli entérotoxinogène (Turista)
- Yersinia enterocolitica
- Vibrio cholerae/vulnificus/parahaemolyticus
- Plesiomonas shigelloides
- Clostridium difficile toxinogène
- Giardia sp. intestinales
- Entamoeba histolytica
- Cryptosporidium spp. (C. hominis et C. parvum)

AVANTAGES DE L’APPROCHE SYNDROMIQUE MOLÉCULAIRE :
- Raccourcissement du délai de rendu de résultat : premier résultat positif ou négatif dans la journée
- Augmentation de la sensibilité diagnostique par rapport aux techniques classiques de recherche des agents entéropathogènes
- Pas de modification de la prescription
- Pas de coût supplémentaire

Cette technique sera progressivement généralisée à d’autres analyses : recherche des virus entériques, recherche de candidoses et de vaginoses…

Biologistes responsables : Dr Matthieu Lefranc matthieu.lefranc@cbm25.fr et Dr Marie-Carole Paolini marie-carole.paolini@cbm25.fr